同域分布三种木蓼属植物的叶绿体基因组比较研究
褚振州 田新民 屈泽众 古丽巴哈尔·依斯拉木
植物学报. 2023, 58(3):
0-0.
doi:10.11983/CBB22065
摘要
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刺木蓼、额河木蓼和细枝木蓼是同域分布在我国新疆北部的三种木蓼属物种, 为检测这三个物种的叶绿体基因组差异, 本研究通过二代高通量测序, 对叶绿体基因组进行组装和注释, 比较了三个物种的叶绿体基因组差异并进行了系统发育分析。研究发现木蓼属三个物种的叶绿体全基因组大小为164 106 bp–164 216 bp, 具有典型的四分体结构, 由一个大单拷贝区(LSC)、一个小单拷贝区(SSC)以及介于他们两个区域之间的两个反向重复区(IRa/IRb)组成。在刺木蓼、额河木蓼与细枝木蓼中检测到48–49个串联重复序列和59–63个简单重复序列(SSR)。三个物种的核苷酸多样性平均值为0.00096, Ka/Ks平均值为0.0303, 遗传距离平均值为0.0010。通过对三个物种的叶绿体基因组进行比较, 发现编码区比非编码区更为保守。系统发育结果显示三个物种具有较近的亲缘关系。本研究首次基于叶绿体基因组对木蓼属物种的亲缘关系进行分析, 揭示了三个同域物种之间的亲缘关系以及木蓼属在蓼科中的系统位置。本研究可为木蓼属的分类学、系统学和生物地理学研究提供参考