茶树实时荧光定量PCR分析中内参基因的选择

doi:10.11983/CBB29406

植物学报 ›› 2010, Vol. 45 ›› Issue (05): 579-587.DOI: 10.11983/CBB29406 cstr: 32102.14.j.issn.1674-3466.2010.05.007

茶树实时荧光定量PCR分析中内参基因的选择

孙美莲¹, 王云生², 杨冬青¹, 韦朝领¹, 高丽萍^2*, 夏涛^1*, 单育¹, 骆洋²

¹安徽农业大学农业部茶叶生物化学与生物技术重点实验室, 合肥 230036
²安徽农业大学生命科学学院, 合肥 230036

收稿日期:2009-12-08 修回日期:2010-03-30 出版日期:2010-09-01 发布日期:2010-09-20
通讯作者: 高丽萍;夏涛

Reference Genes for Real-time Fluorescence Quantitative PCR in Camellia sinensis

Meilian Sun¹, Yunsheng Wang², Dongqing Yang¹, Chaoling Wei¹, Liping Gao^2*, Tao Xia^1*, Yu Shan¹, Yang Luo²

¹Key Laboratory of Tea Biochemistry and Biotechnology, Ministry of Agriculture, Anhui Agricultural University, Hefei 230036,China

²School of Biology Science, Anhui Agricultural University, Hefei 230036, China

Received:2009-12-08 Revised:2010-03-30 Online:2010-09-01 Published:2010-09-20
Contact: Liping Gao, Tao Xia

摘要/Abstract

摘要： 选择合适的内参基因是提高实时荧光定量PCR分析(qRT-PCR)准确性的先决条件。该文以茶树(Camellia sinensis) 芽、叶、幼根、嫩茎、花瓣、种子和愈伤组织为材料, 应用实时荧光定量PCR技术, 分析了18S rRNA、GAPDH、β-actin和α-tubulin 4个常用内参基因在茶树不同器官组织中的表达情况。经GeNorm和NormFinder软件分析发现, 当利用荧光定量PCR分析比较茶树不同器官组织中的基因表达差异时, 可选择β-actin作为校正内参基因; 而比较不同成熟度的叶片和愈伤组织时, 可以选择GAPDH作为校正内参基因。

关键词: 茶树, 实时荧光定量PCR, 内参基因

Abstract: The selection of a suitable reference gene is an important prerequisite for successful gene expression analysis by real-time fluorescence quantitative PCR (qPCR). We investigated the expression stability of 4 endogenous candidate genes (18S rRNA, GAPDH, β-actin and α-tubulin) in qPCR experiments in different organs and tissues, including buds, leaves, young roots, stem, petals, seeds, and callus, of the tea plant Camellia sinensis (L.) O. Kuntze. The analysis with GeNorm and NormFinder algorithms revealed that β-actin could be used as a reference gene for organs and tissues and GAPDH for mature leaves and callus.

Key words: Camellia sinensis, real-time fluorescence quantitative PCR, reference genes

孙美莲, 王云生, 杨冬青, 韦朝领, 高丽萍, 夏涛, 单育, 骆洋. 茶树实时荧光定量PCR分析中内参基因的选择. 植物学报, 2010, 45(05): 579-587.

Meilian Sun, Yunsheng Wang, Dongqing Yang, Chaoling Wei, Liping Gao, Tao Xia, Yu Shan, Yang Luo. Reference Genes for Real-time Fluorescence Quantitative PCR in Camellia sinensis. Chinese Bulletin of Botany, 2010, 45(05): 579-587.

导出引用管理器 EndNote|Ris|BibTeX

链接本文: https://www.chinbullbotany.com/CN/10.11983/CBB29406

https://www.chinbullbotany.com/CN/Y2010/V45/I05/579

[1]	仲昭暄, 周绍容, 汤猛, 陈利君, 严岳鸿, 常缨, 王凤攀. 金毛狗实时荧光定量PCR内参基因的鉴别和评价[J]. 植物学报, 2026, 61(2): 1-0.
[2]	任露露, 张有泽, 黄克林, 宛晓春, 张照亮, 朱木兰, 韦朝领. 茶树茎段不定芽高效发生体系的建立[J]. 植物学报, 2023, 58(2): 308-315.
[3]	穆丹, 岂泽华, 李沁, 梁可欣, 华绍贵, 朱星雨, 焦梦婕, 饶玉春, 孙廷哲. 茶树花挥发物对叶蝉三棒缨小蜂的引诱增强效应[J]. 植物学报, 2021, 56(5): 559-572.
[4]	孙廷哲, 岂泽华, 梁可欣, 李沁, 饶玉春, 穆丹. 蚜害茶树挥发物组分变化的聚类分析[J]. 植物学报, 2021, 56(4): 422-432.
[5]	刘建福, 陈育才, 王文建, 王河川, 蔡金福, 王明元, 李丹丹, 张斌, 黄昆. 航天搭载对武夷名丛相关生理及生长特性的影响[J]. 植物学报, 2020, 55(5): 564-572.
[6]	杨小青,黄晓琴,韩晓阳,刘腾飞,岳晓伟,伊冉. 外源物质对茶树耐寒及蔗糖代谢关键基因表达的影响[J]. 植物学报, 2020, 55(1): 21-30.
[7]	张晓玲, 李亦超, 王芸芸, 蔡宏宇, 曾辉, 王志恒. 未来气候变化对不同国家茶适宜分布区的影响[J]. 生物多样性, 2019, 27(6): 595-606.
[8]	刘小妹,孙丽莉,傅向东,廖红. 茶树嫩枝扦插的高效方法[J]. 植物学报, 2019, 54(4): 531-538.
[9]	张登, 李景剑, 张梦洁, 包钰韬, 杨霄, 徐武云, 欧阳昆唏, 陈晓阳. 黄梁木实时荧光定量PCR分析中内参基因的选择[J]. 植物学报, 2018, 53(6): 829-839.
[10]	姜琼, 王幼宁, 王利祥, 孙政玺, 李霞. 盐胁迫下大豆根组织定量PCR分析中内参基因的选择[J]. 植物学报, 2015, 50(6): 754-764.
[11]	林郑和, 钟秋生, 陈常颂, 陈志辉, 游小妹. 不同香型茶树鲜叶挥发性组分与β-葡萄糖苷酶的相关性分析[J]. 植物学报, 2015, 50(6): 713-720.
[12]	苏晓娟, 樊保国, 袁丽钗, 崔秀娜, 卢善发. 实时荧光定量PCR分析中毛果杨内参基因的筛选和验证[J]. 植物学报, 2013, 48(5): 507-518.
[13]	景丹龙, 马江, 张博, 韩逸洋, 刘志雄, 陈发菊. 红花玉兰MwAG基因在花发育不同时期的表达[J]. 植物学报, 2013, 48(2): 145-150.
[14]	李冉, 李建彩, 周国鑫, 娄永根. 水稻虫害诱导相关基因实时定量PCR中内参基因的选择[J]. 植物学报, 2013, 48(2): 184-191.
[15]	袁伟, 万红建, 杨悦俭. 植物实时荧光定量PCR内参基因的特点及选择[J]. 植物学报, 2012, 47(4): 427-436.

茶树实时荧光定量PCR分析中内参基因的选择

Reference Genes for Real-time Fluorescence Quantitative PCR in Camellia sinensis

PDF (PC)

可视化

被引次数

摘要/Abstract

引用本文

使用本文

参考文献

相关文章 15

编辑推荐

Metrics

本文评价