园艺植物分子育种相关生物信息资源及其应用

植物学报 ›› 2005, Vol. 22 ›› Issue (04): 494-501.

园艺植物分子育种相关生物信息资源及其应用

^1,2 张长青^①
1 王进 ³ 李广平 ³ 章镇

1. ¹(南京大学生命科学学院医药生物技术国家重点实验室南京 210093)
2. ² (金陵科技学院园艺系南京 210038)
3. ³ (南京农业大学园艺系南京 210095)

收稿日期:2004-05-25 修回日期:2004-09-27 出版日期:2005-08-30 发布日期:2005-08-30
通讯作者: 张长青

Bioinformatics Resources for Molecular Breeding of Horticultural Plants

^1,2ZHANG Chang-Qing^①
1WANG Jin ³LI Guang-Ping ³ZHANG Zhen

1. ¹ (State Key Laboratory of Pharmaceutical Biotechnology, School of Life Science, Nanjing University, Nanjing 210093)
2. ² (Department of Horticulture, Jinling Institute of Technology, Nanjing 210038)
3. ³ (School of Horticulture, Nanjing Agricultural University, Nanjing 210095)

Received:2004-05-25 Revised:2004-09-27 Online:2005-08-30 Published:2005-08-30

摘要/Abstract

摘要： 园艺植物分子育种中, 生物信息技术是一项新技术。GenBank、EMBL、DDBJ、Swiss-Prot等数据库及其序列查询系统、序列比对软件和序列提交软件是园艺植物分子育种中的重要生物信息资源。本文综述了这些生物信息资源, 以及它们在克隆新基因、预测新序列功能、鉴定种质资源和进行系谱分析等方面的应用。

关键词: 生物信息, 园艺植物, 分子育种, 数据库

Abstract: Bioinformatics technology is a new approach used in molecular breeding of horticultural plants. Many databases and tools of bioinformatics, such as GenBank, EMBL, DDBJ, and SWISSPROT, are important resources for molecular breeding research. Horticultural researchers often use these resources to predict the function of sequences of new nucleic acids or proteins, to produce phylogenetic trees, and to clone new genes. The paper reviews the main bioinformatics resources, including the important databases and frequently used service systems, and their applications in molecular breeding of horticultural plants.

Key words: Bioinformatics, Horticultural plants, Molecular breeding, Database

张长青王进李广平章镇. 园艺植物分子育种相关生物信息资源及其应用. 植物学报, 2005, 22(04): 494-501.

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[1]	陈先圣, 王雨晨, 张洪亮, 彭博, 王英力, 黄远. 植物可穿戴传感器在园艺作物生理生化信息感知领域的研究进展[J]. 植物学报, 2026, 61(4): 1-0.
[2]	王伟坤, 傅雯倩, 洪秋梅, 郑杨, 于嘉慧, 王艳, 刘良淼, 杨莉, 王长春, 郭卫东. MicroTom番茄非组培快速遗传转化方法的建立[J]. 植物学报, 2026, 61(3): 475-484.
[3]	王春阳, 杨明, 张康, 刘玉卫, 巩校东, 刘青, 王华玲, 魏世娲, 王荣纳. 新农科视角下的农林院校生物信息专业创新人才培养研究[J]. 植物学报, 2026, 61(2): 341-350.
[4]	陈靖彧, 王文庆, 罗诗语, 杨路祥, 汪慧骏, 吴天宇, 朱乾坤. 岩白菜TCP基因家族的表达模式及代谢关联分析[J]. 植物学报, 2026, 61(1): 26-36.
[5]	闫姿伶, 陈晓宇, 姚蒙. 基于环境DNA宏条形码的无脊椎动物多样性研究: 生物信息学流程比较与评估[J]. 生物多样性, 2026, 34(1): 25369-.
[6]	陶小所, 姚晓华, 姚有华. 藜麦LOC110717159基因克隆、生物信息学分析及其在拟南芥过表达分析[J]. 植物学报, 2026, 61(1): 53-67.
[7]	旦增尼玛, 孙伟, 李聪, 张纾意, 赵竹楠, 许永强, 普布卓玛, 罗诗琦, 达娃, 周欣. 西藏吉隆沟地区开花植物叶绿体基因组数据集[J]. 生物多样性, 2025, 33(9): 25270-.
[8]	廖雅晴, 黄泽锋, 王晓云, 张礼标, 吴毅, 余文华. 广东省翼手目物种名录更新及分子条形码数据库[J]. 生物多样性, 2025, 33(4): 24584-.
[9]	苏晨, 牛钰凡, 徐航, 王希岭, 于英俊, 何雨晴, 王雷. 生物钟与光温环境信号互作网络研究进展[J]. 植物学报, 2025, 60(3): 315-341.
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[14]	张波, 任长忠. 燕麦基因组学与分子育种研究进展[J]. 植物学报, 2022, 57(6): 785-791.
[15]	徐聪, 张飞宇, 俞道远, 孙新, 张峰. 土壤动物的分子分类预测策略评估[J]. 生物多样性, 2022, 30(12): 22252-.