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植物SPL转录因子的生物功能研究进展
曾鑫海, 陈锐, 师宇, 盖超越, 范凯, 李兆伟
植物学报    2023, 58 (6): 982-997.   DOI: 10.11983/CBB22216
摘要   (1304 HTML48 PDF(pc) (1340KB)(3744)  

SPL是植物特有的一类转录因子, 其蛋白结构中存在一段由2个锌指结构和核定位序列构成的高度保守的SBP结构域, 多数SPL基因的转录表达受microRNAs剪切调控。该文结合当前SPLs转录因子的研究进展, 对其在植物生长发育和环境适应等方面的生物学功能进行综述, 并对SPLs的研究前景进行展望。



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图1 MicroRNA对SPLs基因的转录调控示意图
SBP: SQUAMOSA启动子结合蛋白; NLS: 核定位信号; RISC: RNA诱导沉默复合体
正文中引用本图/表的段落
基因的表达调控可在多个水平上进行, 如转录、转录后、翻译及翻译后修饰。目前研究比较深入的是SPL转录因子在转录后水平的调控(图1)。其中, 与microRNA156结合并降解SPL转录产生的mRNA为主要途径。microRNA156最初在拟南芥中发现, 是长度约为20个核苷酸的非编码单链RNA序列, 结构较为保守, 能特异性识别特定SPL转录产生的mRNA序列, 并通过剪切降解mRNA片段使其不能正常翻译(Jones- Rhoades et al., 2006)。目前研究发现, 在拟南芥的17个SPL基因中, 有11个SPL序列含有microRNA-156识别位点, 在水稻(Oryza sativa)的19个SPL基因中, 有12个SPL序列具有microRNA156识别位点。此外, 高粱(Sorghum bicolor)、玉米(Zea mays)、黄瓜(Cucumis sativus)、柳枝稷(Panicum virgatum)和葡萄(Vitis vinifera)中分别有10、19、11、21和12个SPL基因包含microRNA156识别位点(Rhoades et al., 2002; Schwab et al., 2005; Bonnet et al., 2010; Dai and Zhao, 2011; Hou et al., 2013; Wu et al., 2016), 可见microRNA156SPL基因表达中发挥重要调控作用。Gandikota等(2007)对拟南芥AtSPL3基因的microRNA156识别位点进行突变, 发现突变植株中AtSPL3的转录水平显著提高, 而microRNA156的含量与植物的生理年龄呈负相关, 降低microRNA156活性会导致植物出现早熟表型(Cheng et al., 2021)。AHL蛋白(AT-hook motif nuclear localized)可以通过提高microRNA156/157的表达量抑制SPL的mRNA翻译(Rahimi et al., 2022)。将番茄(Solanum lycopersicum)的SISPL13与35S-microRNA156a载体在瞬时表达系统中共表达时, SISPL13蛋白的含量下降至较低水平(Cui et al., 2020)。水稻OsSPL14可调控水稻穗分枝, 当OsSPL14基因的microRNA156识别位点发生单碱基突变时, 水稻穗的分枝数显著增多(Miura et al., 2010; Jiao et al., 2010)。在柑橘(Citrus reticulata)中, microRNA156/SPL模型调控柑橘愈伤组织的体细胞胚胎发生(Long et al., 2018)。Yun等(2022)在大豆(Glycine max)中发现, microRNA156能直接结合并降解GmSPL9d的mRNA片段, 进而负调控大豆结瘤。
SPL转录因子能调控根系的分生区和根冠发育.Barrera-Rojas等(2020)研究发现, 当拟南芥AtSPL10表达受到抑制时, 可以通过调节细胞分裂素(cytokinin, CTK)途径来调控根系分生组织的活性.Shao等(2019)研究表明, 水稻OsSPL3和OsSPL12参与植株根冠生长的调节过程, 其中, OsSPL3与靶基因OsMADS50相互作用, 调节生长素的运输和信号转导, 进而影响根冠发育, 并且OsSPL3的表达受microRNA156调控.此外, microRNA156-OsSPL3-OsMADS50互作途径也参与水稻的不定根发育调控. ...
Genomic organization, phylogenetic comparison and differential expression of the SBP-box family genes in grape
1
2013
... 基因的表达调控可在多个水平上进行, 如转录、转录后、翻译及翻译后修饰.目前研究比较深入的是SPL转录因子在转录后水平的调控(图1).其中, 与microRNA156结合并降解SPL转录产生的mRNA为主要途径.microRNA156最初在拟南芥中发现, 是长度约为20个核苷酸的非编码单链RNA序列, 结构较为保守, 能特异性识别特定SPL转录产生的mRNA序列, 并通过剪切降解mRNA片段使其不能正常翻译(Jones- Rhoades et al., 2006).目前研究发现, 在拟南芥的17个SPL基因中, 有11个SPL序列含有microRNA-156识别位点, 在水稻(Oryza sativa)的19个SPL基因中, 有12个SPL序列具有microRNA156识别位点.此外, 高粱(Sorghum bicolor)、玉米(Zea mays)、黄瓜(Cucumis sativus)、柳枝稷(Panicum virgatum)和葡萄(Vitis vinifera)中分别有10、19、11、21和12个SPL基因包含microRNA156识别位点(Rhoades et al., 2002; Schwab et al., 2005; Bonnet et al., 2010; Dai and Zhao, 2011; Hou et al., 2013; Wu et al., 2016), 可见microRNA156SPL基因表达中发挥重要调控作用.Gandikota等(2007)对拟南芥AtSPL3基因的microRNA156识别位点进行突变, 发现突变植株中AtSPL3的转录水平显著提高, 而microRNA156的含量与植物的生理年龄呈负相关, 降低microRNA156活性会导致植物出现早熟表型(Cheng et al., 2021).AHL蛋白(AT-hook motif nuclear localized)可以通过提高microRNA156/157的表达量抑制SPL的mRNA翻译(Rahimi et al., 2022).将番茄(Solanum lycopersicum)的SISPL13与35S-microRNA156a载体在瞬时表达系统中共表达时, SISPL13蛋白的含量下降至较低水平(Cui et al., 2020).水稻OsSPL14可调控水稻穗分枝, 当OsSPL14基因的microRNA156识别位点发生单碱基突变时, 水稻穗的分枝数显著增多(Miura et al., 2010; Jiao et al., 2010).在柑橘(Citrus reticulata)中, microRNA156/SPL模型调控柑橘愈伤组织的体细胞胚胎发生(Long et al., 2018).Yun等(2022)在大豆(Glycine max)中发现, microRNA156能直接结合并降解GmSPL9d的mRNA片段, 进而负调控大豆结瘤. ...
The elite alleles of OsSPL4 regulate grain size and increase grain yield in rice
1
2021a
... 当前研究表明, SPL转录因子在禾谷类作物的产量形成及浆果类植物的果实发育过程中也发挥重要调控作用.以水稻产量性状为例, SPL转录因子主要调控水稻的穗分枝、穗粒数及粒型等.例如, 有研究表明转录因子OsSPL4、OsSPL13以及OsSPL16通过调控细胞分裂素水平来增加粒宽, 进而影响水稻的粒型 (Wang et al., 2012; Si et al., 2016; Hu et al., 2021a).在水稻分蘖、穗分枝及穗粒数等性状形成过程中, 转录因子OsSPL9可在幼穗分化早期直接激活花序分生组织特性基因RCN1 (rice TERMINAL FLOWER1/CENTRORADIALIS homolog)的表达, 进而调控水稻的穗分枝和穗粒数(Hu et al., 2021b); Yuan等(2019)研究表明, OsSPL18通过直接结合水稻直立密穗控制基因DEP1的启动子正调控其表达, 进而调节水稻穗型; 与野生型相比, osspl18突变体穗长、穗粒数以及粒宽等产量性状指标均减小, 但是分蘖数相对增多.Miura等(2010)研究发现, 转录因子OsSPL14通过促进水稻生殖生长期的穗分枝进而提高稻谷产量.此外, Zhang等(2021)研究表明, OsSPL12通过结合水稻粒宽关键基因GW5 (Grain width 5)的启动子负调控水稻粒宽; 粳稻中低活性OsSPL12可增加粒宽, 籼稻中高活性OsSPL12可降低粒宽.Gupta等(2023)利用CRISPR-Cas9技术编辑TaSPL13基因的microRNA156识别元件位点, 发现突变植株的籽粒大小和穗粒数均较野生型增加.Tripathi等(2020)发现二穗短柄草(Brachypodium distachyon) BdSBP9突变株的穗长显著变短. ...
OsSPL9 regulates grain number and grain yield in rice
2
2021b
... The SPLs are involved in the regulation of plant growth and development
独脚金内酯(strigolactones, SLs)是高等植物中普遍存在的一种新型植物激素.近年来, 陆续有研究表明转录因子SPLs参与独脚金内酯信号转导与调控过程, 进而影响植物分蘖等表型构建.D53 (DWARF53)是SL信号通路的关键阻遏因子, Song等(2017)研究发现, 水稻D53能够与IPA1 (Ideal Plant Architecture1, 即转录因子OsSPL14)互作, 抑制IPA1的转录, 且IPA1还能直接与D53的启动子结合调控其表达.玉米中也发现有类似的调控途径.例如, Liu等(2021)指出, D53与UB3和TSH4存在互作, 并抑制它们对TB1的转录激活, 进而促进玉米分蘖, 且D53还可以结合UB3TSH4的启动子抑制其转录.此外, Yang等(2022)研究发现, 柳枝稷PvSPL2可直接正调控SL生物合成重要基因PvLBO的表达. ...
miR156-independent repression of the ageing pathway by longevity-promoting AHL proteins in Arabidopsis
3
2022
... 基因的表达调控可在多个水平上进行, 如转录、转录后、翻译及翻译后修饰.目前研究比较深入的是SPL转录因子在转录后水平的调控(图1).其中, 与microRNA156结合并降解SPL转录产生的mRNA为主要途径.microRNA156最初在拟南芥中发现, 是长度约为20个核苷酸的非编码单链RNA序列, 结构较为保守, 能特异性识别特定SPL转录产生的mRNA序列, 并通过剪切降解mRNA片段使其不能正常翻译(Jones- Rhoades et al., 2006).目前研究发现, 在拟南芥的17个SPL基因中, 有11个SPL序列含有microRNA-156识别位点, 在水稻(Oryza sativa)的19个SPL基因中, 有12个SPL序列具有microRNA156识别位点.此外, 高粱(Sorghum bicolor)、玉米(Zea mays)、黄瓜(Cucumis sativus)、柳枝稷(Panicum virgatum)和葡萄(Vitis vinifera)中分别有10、19、11、21和12个SPL基因包含microRNA156识别位点(Rhoades et al., 2002; Schwab et al., 2005; Bonnet et al., 2010; Dai and Zhao, 2011; Hou et al., 2013; Wu et al., 2016), 可见microRNA156SPL基因表达中发挥重要调控作用.Gandikota等(2007)对拟南芥AtSPL3基因的microRNA156识别位点进行突变, 发现突变植株中AtSPL3的转录水平显著提高, 而microRNA156的含量与植物的生理年龄呈负相关, 降低microRNA156活性会导致植物出现早熟表型(Cheng et al., 2021).AHL蛋白(AT-hook motif nuclear localized)可以通过提高microRNA156/157的表达量抑制SPL的mRNA翻译(Rahimi et al., 2022).将番茄(Solanum lycopersicum)的SISPL13与35S-microRNA156a载体在瞬时表达系统中共表达时, SISPL13蛋白的含量下降至较低水平(Cui et al., 2020).水稻OsSPL14可调控水稻穗分枝, 当OsSPL14基因的microRNA156识别位点发生单碱基突变时, 水稻穗的分枝数显著增多(Miura et al., 2010; Jiao et al., 2010).在柑橘(Citrus reticulata)中, microRNA156/SPL模型调控柑橘愈伤组织的体细胞胚胎发生(Long et al., 2018).Yun等(2022)在大豆(Glycine max)中发现, microRNA156能直接结合并降解GmSPL9d的mRNA片段, 进而负调控大豆结瘤. ...

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