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植物基因选择性剪接: 断舍离合, 达权知变
植物学报
2022, 57 (5):
661-672.
DOI: 10.11983/CBB22041
选择性剪接是基因转录后的mRNA通过不同的剪接方式产生多样性成熟转录本的过程, 是真核生物细胞中一种重要的转录后调控方式。植物基因也常通过这种断舍离合的方式产生一专多能的转录本, 达到调节多种生命活动的目的。相较于动物, 植物中该领域的研究起步较晚, 但近年来也取得了长足的进步。该文综述了植物基因选择性剪接的生物学意义、剪接方式和机制、研究方法以及在生长发育与环境胁迫适应性调节中的作用, 并展望了未来的研究方向。  View image in article
图2
基因选择性剪接的模式
不同颜色的方框表示不同外显子; 方框之间的黑色直线表示内含子; 红色折线表示内含子剪接部位; 黑色箭头表示启动子控制的转录起始位点。
正文中引用本图/表的段落
与组成型剪接不同, 已报道的AS模式包括外显子跳跃(exon skipping)、内含子保留(intron retention)、外显子互斥(mutually exclusive exons)以及选择性5?或3?剪接位点(alternative 5? or 3? splice site)等形式(Eckardt et al., 2013) (图2)。虽然选择性启动子(alternative promoter)和选择性多腺化位点(alternative polyadenylation)不是严格意义上的AS, 但从研究结果来看与AS产生的转录水平调控有诸多相似之处, 因此也常被归为AS的方式(Blencowe, 2006; Singer et al., 2008; Laloum et al., 2018)。组学研究发现, 人类细胞中基因AS事件出现频率较高的是外显子跳跃, 约占AS事件的40%; 选择性5?或3?剪接位点事件约占26%; 内含子保留占比不到5%, 而在植物中的规律与此并不一致。拟南芥中AS事件出现频率最高的方式是内含子保留, 约占AS事件的40%, 其次是选择性5?或3?剪接位点, 约占23%; 然后是外显子跳跃, 约占8%; 其它的AS形式出现较少(Reddy et al., 2013)。
本文的其它图/表
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