戴雪妍1,
2, 张正海2, 曹亚从2,
苏强2, 吴华茂1,
2*, 王立浩1,
2*
1三亚中国农业科学院国家南繁研究院, 海南省种业实验室, 三亚 572024; 2中国农业科学院蔬菜花卉研究所, 蔬菜生物育种全国重点实验室, 北京 100081
Xueyan
Dai1, 2, Zhenghai Zhang2, Yacong Cao2, Qiang
Su2, Huamao Wu1, 2*, Lihao Wang1, 2*
1Sanya National Nanfan Research Institute of the Chinese Academy of Agricultural Sciences, Hainan Yazhou Bay Seed Industry Lab, Sanya 572024, China; 2Institute of Vegetables & Flowers, Chinese Academy of Agricultural Sciences, State Key Laboratory of Vegetable Biobreeding, Beijing 100081, China
摘要： 空间转录组学是获取并解析转录组空间位置信息的重要工具。近年来, 随着分辨率、通量和灵敏度的提升, 该技术在生命科学领域取得了显著进展。目前, 空间转录组学在生物、医药和植物学等多个领域得到广泛应用。该文回顾了空间转录组学发展历程, 介绍了主流技术、技术选择策略及相关实验流程, 概述了空间转录组学在细胞类型识别与功能解析、植物生长发育、抗逆机制及作物育种应用中取得的进展。此外, 文章还从空间转录组学视角进行跨物种比较, 提出了目前技术发展中存在分辨率与通量平衡、植物组织的特殊性、数据分析和标准化等方面的瓶颈问题。最后, 展望了未来空间转录组学在技术创新、辅助分子生物育种, 以及数据整合与平台构建等中的潜在研究方向, 旨在为相关领域的研究提供参考借鉴。
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