植物学报

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大豆KNOX基因家族的结构和表达分析

李方正, 杨素欣*, 吴春霞, 魏海超, 曲瑞莲, 冯献忠   

  1. 山东师范大学生命科学学院, 山东省高校系统生物学重点实验室, 济南 250014
  • 收稿日期:2012-01-19 修回日期:2012-04-01 出版日期:2012-05-01 发布日期:2012-07-06
  • 通讯作者: 杨素欣

Structure and Expression Analysis of KNOX Gene Family in Soybean

Fangzheng Li, Suxin Yang*, Chunxia Wu, Haichao Wei, Ruilian Qu, Xianzhong Feng   

  1. Key Laboratory of Systems Biology in Universities of Shandong, College of Life Sciences, Shandong Normal University, Jinan 250014, China
  • Received:2012-01-19 Revised:2012-04-01 Online:2012-05-01 Published:2012-07-06
  • Contact: Suxin Yang

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摘要： KNOX基因家族编码同源异型盒蛋白, 在植物生长发育过程中起重要调控作用。利用生物信息学手段在全基因组水平上对大豆(Glycine max)KNOX家族基因进行鉴定和分类, 并分析其基因结构、蛋白同源结构域特征以及基因表达方式。研究结果表明: 大豆中的27个GmKNOX基因可以分为GmKNOX I和GmKNOX II两个亚类, 其中GmKNOX I类可分为3个主要的进化支, GmKNOX II类分为2个主要的进化支; 26个GmKNOX基因不均匀地分布在16条染色体上, GmKNOX27尚无法定位。不同组织表达谱的分析表明: GmKNOX I类基因表达部位比较集中, 以茎顶端分生组织中表达量最高; 而GmKNOX II类基因的表达特异性较GmKNOX I类低, 表达部位更广泛。

Abstract: KNOX family genes, coding homeobox proteins, play an important role in plant development. We investigated soybean KNOX family genes with genome database analysis and bioinformatics. Phylogenetic analysis characterized 2 classes of GmKNOX genes: GmKNOX I with 3 sub-classes and GmKNOX II with 2. In total, 26 GmKNOX genes distribute in 16 chromosomes of soybean, and GmKNOX27 could not be located in any chromosome. Whole-genome expression analysis revealed class I GmKNOX genes mainly expressed in meristematic tissues and class II GmKNOX genes broadly expressed in different tissues.

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