植物学报 ›› 2018, Vol. 53 ›› Issue (6): 793-800.DOI: 10.11983/CBB17215
舒江平1,2, 罗俊杰1, 韦宏金1, 严岳鸿1,2,3,*()
收稿日期:
2017-11-13
出版日期:
2018-11-01
发布日期:
2018-12-05
通讯作者:
严岳鸿
作者简介:
作者简介:白克智, 1959年开始在中国科学院植物研究所工作, 先后任助理研究员、研究员, 长期从事植物生长发育及其调控的研究。1986年,其主持的“满江红生物学特性研究”荣获中国科学院科技进步二等奖。曾任《植物生理学报》编委、《植物学报》常务编委、中国植物生长调节剂协会主任等职。
基金资助:
Shu Jiangping1,2, Luo Junjie1, Wei Hongjin1, Yan Yuehong1,2,3,*()
Received:
2017-11-13
Online:
2018-11-01
Published:
2018-12-05
Contact:
Yan Yuehong
摘要: 地球上有多少物种一直以来都是人们极度关注的问题, 而存疑物种是造成该问题难以解决的重要阻碍之一。目前, 模式标本是存疑物种得以确定的唯一凭证标准, 然而, 因其特殊的分类学地位而难以进行有效的观察和研究。因此, 前往模式产地寻找存疑物种的原始信息成为最有效的替代途径。随着分子生物学, 特别是DNA条形码技术在物种分类与鉴定中的广泛应用, 准确而快速鉴定存疑物种成为可能。以存疑物种——南平鳞毛蕨(Dryopteris yenpingensis)为例, 利用来自模式产地的分子数据进行DNA条形码分析, 并结合形态学特征澄清了南平鳞毛蕨的分类学地位, 确定南平鳞毛蕨与荔波鳞毛蕨(D. liboensis)为同一物种, 同意将荔波鳞毛蕨作为其异名。研究结果和方法可为今后澄清更多存疑物种的分类学地位提供参考。
舒江平, 罗俊杰, 韦宏金, 严岳鸿. 基于模式产地的分子证据澄清南平鳞毛蕨的分类学地位. 植物学报, 2018, 53(6): 793-800.
Shu Jiangping, Luo Junjie, Wei Hongjin, Yan Yuehong. Clarifying the Taxonomic Status of Dryopteris yenpingensis based on Materials from the Type Locality. Chinese Bulletin of Botany, 2018, 53(6): 793-800.
Voucher number | Species name | Collection site |
---|---|---|
ZXC7305 | Dryopteris liboensis | Guizhou, China |
ZXC7273 | D. liboensis | Guizhou, China |
WYD043 | D. liboensis | Guangdong, China |
WYD066 | D. integriloba | Guangdong, China |
JSL5149 | D. yenpingensis | Fujian, China |
JSL3693 | D. integriloba | Guangxi, China |
JSL5083 | D. integriloba | Guangxi, China |
表 1 本研究所用材料的标本信息
Table 1 The information of the specimens in present study
Voucher number | Species name | Collection site |
---|---|---|
ZXC7305 | Dryopteris liboensis | Guizhou, China |
ZXC7273 | D. liboensis | Guizhou, China |
WYD043 | D. liboensis | Guangdong, China |
WYD066 | D. integriloba | Guangdong, China |
JSL5149 | D. yenpingensis | Fujian, China |
JSL3693 | D. integriloba | Guangxi, China |
JSL5083 | D. integriloba | Guangxi, China |
图 3 南平鳞毛蕨的植株、孢子和鳞片形态(A) 植株; (B) 叶片; (C) 根状茎; (D) 孢子; (E) 鳞片
Figure 3 The plants, spores and scales of Dryopteris yenpingensis(A) Plants; (B) Frond; (C) Rhizome; (D) Spore; (E) Scale
[1] | 《福建植物志》编写组 (1991). 福建植物志(第1卷) (修订本). 福州: 福建科学技术出版社. pp. 210-210. |
[2] | 贾渝, 何思 (2016). 中国生物物种名录——苔藓植物. 北京: 科学出版社. |
[3] | 李春香, 陆树刚 (2006). 鳞毛蕨科植物的系统发育: 叶绿体rbcL序列的证据. 植物分类学报 44, 503-515. |
[4] | 李树刚 (1982). 润楠属. 见: 中国科学院中国植物志编辑委员会, 中国植物志, 第31卷. 北京: 科学出版社. pp. 7-68. |
[5] |
刘红梅, 张宪春, 曾辉 (2009). DNA序列在蕨类分子系统学研究中的应用. 植物学报 44, 143-158.
DOI URL |
[6] |
卢金梅, 李德铢, 吴丁 (2007). 鳞毛蕨科的孢子形态研究. 云南植物研究 29, 397-408.
DOI URL |
[7] |
王凡红, 卢金梅, 李德铢 (2014). 铁线蕨属3个种的分布新记录. 西北植物学报 34, 1055-1060.
DOI URL |
[8] | 王全喜, 戴锡玲 (2010). 中国水龙骨目(真蕨目)植物孢子形态的研究. 北京: 科学出版社. |
[9] |
王全喜, 于晶 (2003). 扫描电镜下真蕨目孢子表面纹饰的分类. 云南植物研究 25, 313-320.
DOI URL |
[10] | 邢公侠 (1982). 蕨类名词及名称. 北京: 科学出版社. |
[11] | 严岳鸿, 张宪春, 周喜乐, 孙久琼 (2016). 中国生物物种名录, 第1卷. 植物(蕨类植物). 北京: 科学出版社. |
[12] |
张宪春, 卫然, 刘红梅, 何丽娟, 王丽, 张钢民 (2013). 中国现代石松类和蕨类的系统发育与分类系统. 植物学报 48, 119-137.
DOI URL |
[13] | 张宪春, 邢公侠 (1999). 纪念秦仁昌论文集. 北京: 中国林业出版社. |
[14] | 张宪春, 姚正明 (2017). 中国茂兰石松类和蕨类植物. 北京: 科学出版社. |
[15] |
CBOL Plant Working Group (2009). A DNA barcode for land plants.Proc Natl Acad Sci USA 106, 12794-12797.
DOI URL |
[16] | Ching RC (1931). The studies of Chinese ferns. V.Bull Fan Mem Inst Biol 2, 185-223. |
[17] | Ching RC (1938). A revision of the Chinese and Sikkim HimalayanDryopteris with reference to some species from neighbouring regions. Bull Fan Mem Inst Biol Bot Ser 8, 363-507. |
[18] | Ching RC (1941). New family and combinations of ferns.Bull Fan Mem Inst Biol Bot Ser 10, 235-256. |
[19] |
Ebach MC, Holdrege C (2005). DNA barcoding is no substitute for taxonomy.Nature 434, 697.
DOI URL PMID |
[20] | Hall TA (1999). BioEdit: a user-friendly biological sequence alignment editor and analysis program for Windows 95/98/NT.Nucl Acids Symp Ser 41, 95-98. |
[21] |
Hebert PDN, Cywinska A, Ball SL, deWaard JR (2003). Biological identifications through DNA barcodes.Proc Roy Soc B: Biol Sci 270, 313-321.
DOI URL |
[22] |
Hollingsworth PM, Graham SW, Little DP (2011). Choosing and using a plant DNA barcode.PLoS One 6, e19254.
DOI URL |
[23] |
Holttum RE (1988). Studies in the fern genera allied to Tectaria Cav. VII. Species of Tectaria sect. Sagenia(Presl) Holttum in Asia excluding Malesia. Kew Bull 43, 475-489.
DOI URL |
[24] | Liou H (1934). Lauracées de Chine et d’Indochine: Contribution à l’étude Systématique et Phytogéographique. Paris: Hermann et Cie. |
[25] |
May RM (1988). How many species are there on earth?Science 241, 1441-1449.
DOI URL |
[26] |
May RM (1990). How many species?Philos Trans Roy Soc B: Biol Sci 330, 293-304.
DOI URL |
[27] |
Meusnier I, Singer GAC, Landry JF, Hickey DA, Hebert PDN, Hajibabaei M (2008). A universal DNA mini- barcode for biodiversity analysis.BMC Genom 9, 214.
DOI URL |
[28] |
Mora C, Tittensor DP, Adl S, Simpson AGB, Worm B (2011). How many species are there on earth and in the ocean?PLoS Biol 9, e1001127.
DOI URL PMID |
[29] |
Ronquist F, Huelsenbeck JP (2003). MrBayes 3: Bayesian phylogenetic inference under mixed models.Bioinforma- tics 19, 1572-1574.
DOI URL |
[30] |
Scheffers BR, Joppa LN, Pimm SL, Laurance WF (2012). What we know and don’t know about Earth’s missing biodiversity.Trends Ecol Evol 27, 501-510.
DOI URL |
[31] | Schindel DE, Miller SE (2005). DNA barcoding a useful tool for taxonomists.Nature 435, 17. |
[32] |
Shu JP, Shang H, Jin DM, Wei HJ, Zhou XL, Liu HM, Gu YF, Wang Y, Wang FG, Shen H, Zhang R, Adjie B, Yan YH (2017). Re-establishment of species from synonymies based on DNA barcoding and phylogenetic analysis using Diplopterygium simulans(Gleicheniaceae) as an example. PLoS One 12, e0164604.
DOI URL PMID |
[33] |
Tamura K, Stecher G, Peterson D, Filipski A, Kumar S (2013). MEGA6: molecular evolutionary genetics analysis version 6.0.Mol Biol Evol 30, 2725-2729.
DOI URL PMID |
[34] | Tryon AF, Lugardon B (1991). Spores of the Pteridophyta. New York: Springer. |
[35] | Wei FN, Henk W (2008). Machilus. In: Wu ZY, Raven PH, Hong DY, eds. Flora of China, Vol. 7. Beijing: Science Press; St. Louis: Missouri Botanical Garden Press. pp. 201-224. |
[36] | Zhang LB, Wang PS, Wang XY (2012). Dryopteris liboensis(Dryopteridaceae), a new species in Dryopteris sect. Erythrovariae from Guizhou, China. Novon 22, 256-259. |
[37] | Zhang LB, Wu SG, Xiang JY, Xing FW, He H, Wang FG, Lu SG, Dong SY, Barrington DS, Iwatsuki K, Christenhusz MJM, Mickel JT, Kato M, Gilbert MG (2013). Dryopteridaceae. In: Wu ZY, Raven PH, Hong DY, eds. Flora of China, Vol. 2-3(Pteridophytes). Beijing: Science Press; St. Louis: Missouri Botanical Garden Press. pp. 541-724. |
[1] | 何智荣, 吴思雨, 时莹莹, 王雨婷, 江艺欣, 张春娜, 赵娜, 王苏盆. 壶菌及其感染对两栖动物种群影响的研究现状与挑战[J]. 生物多样性, 2024, 32(2): 23274-. |
[2] | 彭昀月, 靳彤, 张小全. 生物多样性信用的概念、原则、交易和挑战[J]. 生物多样性, 2024, 32(2): 23300-. |
[3] | 吴相獐, 雷富民, 单壹壹, 于晶. 上海城市公园苔藓植物多样性分布格局及其环境影响因子[J]. 生物多样性, 2024, 32(2): 23364-0. |
[4] | 张飞飞, 杨天凤, 陈莉荣, 刘冬梅, 杨柳园, 杨杜宇, 鞠鹏, 陆露. 被子植物花粉颜色多样性及应用研究进展[J]. 生物多样性, 2024, 32(1): 23346-. |
[5] | 刘昱齐, 刘晶岚, 樊晓丽, 胡宜深, 郭鸿筱, 薛凡. 鸟鸣多样性感知与声景感知恢复性: 鸟鸣音频和科普的干预[J]. 生物多样性, 2024, 32(1): 23230-. |
[6] | 韩丽霞, 王永健, 刘宣. 外来物种入侵与本土物种分布区扩张的异同[J]. 生物多样性, 2024, 32(1): 23396-. |
[7] | 陈进. 《昆明-蒙特利尔全球生物多样性框架》与国家植物园体系建设[J]. 生物多样性, 2023, 31(9): 23257-. |
[8] | 冯晨, 张洁, 黄宏文. 统筹植物就地保护与迁地保护的解决方案: 植物并地保护(parallel situ conservation)[J]. 生物多样性, 2023, 31(9): 23184-. |
[9] | 陈慧妹, 李文军, 邱娟, 马占仓, 李波, 杨宗宗, 闻志彬, 孟岩, 曹秋梅, 邱东, 刘丹辉, 金光照. 新疆野生维管植物名录[J]. 生物多样性, 2023, 31(9): 23124-. |
[10] | 罗正明, 刘晋仙, 张变华, 周妍英, 郝爱华, 杨凯, 柴宝峰. 不同退化阶段亚高山草甸土壤原生生物群落多样性特征及驱动因素[J]. 生物多样性, 2023, 31(8): 23136-. |
[11] | 邓晶, 李艺, 侯一蕾. 城市生物多样性保护: 基于中欧对比视角下的经验借鉴[J]. 生物多样性, 2023, 31(8): 23070-. |
[12] | 罗小燕, 李强, 黄晓磊. 戴云山国家级自然保护区访花昆虫DNA条形码数据集[J]. 生物多样性, 2023, 31(8): 23236-. |
[13] | 杜红. “物种”与“个体”: 究竟谁是生物多样性保护的恰当对象?[J]. 生物多样性, 2023, 31(8): 23140-. |
[14] | 朱旭, 李嘉奇. 全球协同落实《昆明-蒙特利尔全球生物多样性框架》的挑战与出路: 基于SFIC模型的分析[J]. 生物多样性, 2023, 31(8): 23167-. |
[15] | 苏荣菲, 陈睿山, 郭晓娜. 城市社区更新中生物多样性的保护策略: 以上海市长宁区生境花园为例[J]. 生物多样性, 2023, 31(7): 23118-. |
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