植物细胞自噬基因的功能与转录调控机制

李喜豹, 赖敏怡, 梁山, 王小菁, 高彩吉, 杨超

Function and Transcriptional Regulation of Autophagy-related Genes in Plants

Xibao Li, Minyi Lai, Shan Liang, Xiaojing Wang, Caiji Gao, Chao Yang

表2 逆境胁迫诱导表达的植物自噬基因

Table 2 Up-regulated autophagy genes upon stress treatments in plants

物种 发育时期/组织 胁迫类型/时间 检测方法 自噬基因表达 参考文献 拟南芥 (Arabidopsis thaliana) 4周/叶 淹水胁迫/24小时 qRT-PCR 6个AtATG上调 Chen et al. 2015 2周/幼苗 缺锌胁迫/14天 13个AtATG上调 Eguchi et al. 2017 5天/幼苗 42°C热激后/24小时 33个AtATG上调 Sedaghatmehr et al. 2019 5天/幼苗 光照到黑暗/24小时 11个AtATG上调 Yang et al. 2020a 30天/茎叶 黑暗胁迫/3天 RNA-Seq 23个AtATG上调 Yan et al. 2019 4周/叶 黑暗胁迫/6天 Microarray 14个AtATG上调 van der Graaff et al. 2006 水稻 (Oryza sativa) 3周/整株苗 250 mmol·L-1 NaCl/4小时 qRT-PCR 13个OsATG上调 Xia et al. 2011 干旱胁迫/4小时 13个OsATG上调 4°C冷胁迫/4小时 21个OsATG上调 黑暗胁迫/48小时 19个OsATG上调 碳饥饿/48小时 17个OsATG上调 10天/整株苗 氮饥饿/7天 18个OsATG上调 物种 发育时期/组织 胁迫类型/时间 检测方法 自噬基因表达 参考文献 烟草 (Nicotiana tabacum) 2周/整株苗 碳饥饿/48小时 qRT-PCR 17个NtATG上调 Zhou et al. 2015 氮饥饿/48小时 16个NtATG上调 黑暗胁迫/48小时 16个NtATG上调 250 mmol·L-1 NaCl/4小时 14个NtATG上调 4°C冷胁迫/4小时 14个NtATG上调 干旱胁迫/4小时 7个NtATG上调 1 μmol ·L-1 NAA/24小时 6个NtATG上调 5 μmol ·L-1 2,4-D/24小时 5个NtATG上调 25 μmol ·L-1 ABA/24小时 4个NtATG上调 5 μmol ·L-1 GA3/24小时 7个NtATG下调 500 μmol ·L-1 SA/24小时 4个NtATG上调 500 μmol ·L-1 JA/24小时 11个NtATG上调 20 μmol ·L-1 Cu2+/24小时 12个NtATG上调 20 μmol ·L-1 Ni2+/24小时 15个NtATG上调 40 μmol ·L-1 Zn2+/24小时 13个NtATG上调 40 μmol ·L-1 Cd2+/24小时 11个NtATG上调 100 μmol ·L-1 Mn2+/24小时 14个NtATG上调 辣椒 (Capsicum annuum) 5-6叶期/根 200 mmol·L-1 NaCl/3小时 RNA-Seq 9个CaATG上调 Zhai et al. 2016 5-6叶期/茎 15个CaATG上调 5-6叶期/根 干旱胁迫/3小时 7个CaATG上调 5-6叶期/茎 7个CaATG上调 5-6叶期/整株苗 40°C热胁迫/12小时 (耐热品种) 26个CaATG上调 40°C热胁迫/12小时 (热敏感品种) 17个CaATG上调 4°C冷胁迫/3小时 14个CaATG上调 碳饥饿/2天 10个CaATG上调 小麦 (Triticum aestivum) 10天/叶 150 mmol·L-1 NaCl/48小时 RNA-Seq 75个TaATG上调 Yue et al. 2018 4°C冷胁迫/24小时 23个TaATG上调 42°C热胁迫/6小时 36个TaATG上调 干旱胁迫/24小时 23个TaATG上调 2叶期/根-叶 氮饥饿/4天 qRT-PCR 9个TaATG8上调 Zhang et al. 2020 白粉病真菌侵染/36小时(敏感品种) 9个TaATG8上调 白粉病真菌侵染/36小时(抗性品种) 3个TaATG8上调 番茄 (Solanum lycopersicum) 6周/叶 干旱胁迫/6天 qRT-PCR 20个SlATG上调 Wang et al. 2015 6周/叶 500 nmol·L-1 BL/12小时 8个SlATG上调 Wang et al. 2019 5周/叶 4°C冷胁迫/24小时 11个SlATG上调 Chi et al. 2020 香蕉 (Musa nana) 5叶期/根 镰刀菌侵染/51小时 qRT-PCR 8个MaATG上调 Wei et al. 2017 木薯 (Manihot esculenta) 30天/叶 单黄胞菌侵染/6小时 qRT-PCR 25个MeATG上调 Yan et al. 2017 葡萄 (Vitis vinifera) 2年/叶 400 μmol ·L-1 Cu2+/36小时 qRT-PCR 24个VvATG上调 Shangguan et al. 2018 线形草沙蚕 (Tripogon loliiformis) 2月/根-茎 脱水处理 RNA-Seq 10个TlATG上调 Williams et al. 2015