甘薯盐胁迫响应基因IbMYB3的表达特征及生物信息学分析
李格 孟小庆 李宗芸 朱明库
植物学报. 2020, 55(1):
0-0.
doi:10.11983/CBB19094
摘要
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多维度评价
MYB转录因子具有多种生物学功能, 在植物响应生物和非生物胁迫中发挥重要作用。本研究从盐胁迫处理后的甘薯水培苗转录组数据(RNA-seq)中筛选出2个受盐胁迫显著上调表达的MYB基因, 命名为IbMYB3和IbMYB4。在多种非生物胁迫和激素处理下的表达分析显示, IbMYB3基因的表达受逆境诱导显著上调, 暗示其可能参与甘薯非生物胁迫响应。生物信息学分析表明, IbMYB3基因开放阅读框长度为1 059 bp, 编码353个氨基酸, 蛋白分子量为39.41 KDa, 理论等电点PI为5.26, 为酸性带负电的亲水性蛋白。此外, 亚细胞定位实验结果表明, IbMYB3蛋白定位于细胞核, 且该蛋白具有较强的转录激活活性。以上结果表明, IbMYB3转录因子可能在甘薯非生物胁迫响应过程中发挥重要调控作用, 这些结果为进一步探究IbMYB3基因的功能奠定了基础。