%A 刘魏, 童永鳌, 白洁 %T 水稻雄配子体发育过程中tRNA片段的生物信息学分析 %0 Journal Article %D 2018 %J 植物学报 %R 10.11983/CBB17169 %P 625-633 %V 53 %N 5 %U {https://www.chinbullbotany.com/CN/abstract/article_29419.shtml} %8 2018-09-01 %X

tRNA片段(tRF)是tRNA通过非随机剪切产生的RNA片段, 其产生和功能机制尚不明确; 而在水稻(Oryza sativa)雄配子体发育过程中, 人们对tRNA更是知之甚少。通过高通量测序, 在水稻雄配子体发育过程中发现了长度范围较大的tRFs; 进一步采用logo对tRFs两端的序列进行分析, 发现了4个有序列特征(其中3个未见报道)和1个无序列特征的酶切位点; 通过NCBI Blast预测了tRF靶基因, 发现其大多靶向转座因子。研究结果对揭示tRF产生机制以及水稻雄配子体发育研究有一定的参考价值。