植物学报 ›› 2014, Vol. 49 ›› Issue (3): 322-330.DOI: 10.3724/SP.J.1259.2014.00322
张曦1, 侯小改1,3*, 郭大龙2,3*, 宋程威1, 段亚宾1
Xi Zhang1, Xiaogai Hou1,3*, Dalong Guo2,3*, Chengwei Song1, Yabin Duan1
摘要: 利用iPBS方法从西北牡丹(Paeonia suffruticosa)品种红绣球和中原牡丹品种洛阳红中扩增出相应片段, 经回收、克隆及测序, 获得了12条来自牡丹LTR类反转录转座子的LTR序列, 并用相关生物信息学软件对序列进行分析。结果表明, 这些核苷酸序列表现出较高的异质性, 主要表现为缺失突变, 序列长度变化范围为313–894 bp, 同源性从31.1%–65.8%不等。将其氨基酸序列与已登录的不同植物LTR类反转录转座子LTR氨基酸序列进行聚类分析, 结果显示与某些植物相应序列具有较高的同源性, 表明可能存在LTR类反转录转座子的横向传递关系。根据克隆出的LTR序列设计SSAP引物, 对牡丹29个品种进行了SSAP分子标记分析, 结果显示具丰富的多态性。实验验证了用iPBS技术分离牡丹LTR序列的适用性, 并为牡丹种质资源评价提供了新的技术手段。